Ουγκάντα ​​φιλοξενεί το αρχαιότερο πανεπιστήμιο στην Ανατολική και Κεντρική Αφρική, η οποία είναι Makerere University. Το πανεπιστήμιο έχει το κέντρο της ακαδημαϊκής αριστείας για πολλές δεκαετίες, όχι μόνο για τους μαθητές Ουγκάντα, αλλά και άλλους μαθητές στην περιοχή. Η Ουγκάντα ​​έχει πάνω από 30 δημόσια πανεπιστήμια.